Российский Референс-центр по мониторингу возбудителей кишечных инфекций

Цели субвидового типирования

Реконструкция эпидемиологических связей внутри очага кишечных инфекций

Оценка различий между изолятами возбудителя позволяет установить возможную эпидемиологическую связь между источниками инфицирования, факторами передачи возбудителя и пострадавшими в конкретном очаге групповой заболеваемости с выявлением локально действующих факторов передачи. Задача может быть решена отдельной лабораторией, производящей данные исследования.

Реконструкция эпидемиологических связей между очагами на различных территорияx

Оценка различий между изолятами возбудителя позволяет установить возможную эпидемиологическую связь между очагами групповой заболеваемости на различных территориях, с выявлением глобально или регионально распространенных факторов передачи. Задача может быть решена только при организации взаимодействия лабораторий с централизованной базой данных субтипирования изолятов и обеспечения стандартизации используемых методов субтипирования.

Организационная форма взаимодействия с РЦКИ

В настоящее время РЦКИ проводит субвидовое типирование изолятов Salmonella spp. , Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Yersinia pseudotuberculosis, выделенных из очагов групповой заболеваемости, а также любых изолятов энтерогеморрагических E coli (EHEC) и любых клинических изолятов Listeria spp. РЦКИ наряду с рутинными методами субвидового типирования (серотипирование, фаготипирование, биохимическая идентификация, антибиотикорезистентность) применяет в своей работе следующие методы генетического субвидового типирования: Метод анализа набора продуктов рестрикции тотальной ДНК в пульсирующем электрическом поле - пульс-электрофорез (PFGE - Pulsed Field Gel Electrophoresis) с использованием стандартизованных протоколов PulseNet International Network Метод амплификации и анализа участков ДНК содержащих минисаттелитные повторы (VNTR-повторы) - (MLVA);

Правила забора и отправки материала

Для проведения субвидового типирования бактериальных патогенов направляются чистые культуры микроорганизмов в пробирках на среде Cary-Blair, полужидком агаре, плотных скошенных питательных средах (ПА и др.) в зависимости от вида микроорганизма.

Сопроводительная документация

• Направление на лабораторное исследование
• Сопроводительный лист
• В случае регистрации в очаге летального исхода дополнительно направляются
• Ксерокопия клинической истории болезни
• Ксерокопия протокола паталогоанатомического исследования
• Образец заполнения Направления на лабораторное исследование
• Образец заполнения Сопроводительного листа