Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора 111123 Москва ул. Новогиреевская д.3А

Спектр лабораторных исследований



Бактериологические исследования

применяются для выявления Enterobacteriaceae, Campylobacter spp, Vibrio spp (Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus и др. нехолерные вибрионы) и др. бактериальных патогенов

Молекулярно-генетические исследования(исследования проводятся с применением наборов реагентов):

  • «АмплиСенс® ОКИ скрин-FL» № ФСР 2008/02265
  • «АмплиСенс® Эшерихиозы-FL» № ФСР 2010/07977
  • «АмплиСенс® Yersinia enterocolitica/pseudotuberculosis-FL» № ФСР 2010/07830
  • «АмплиСенс® Salmonella typhi -FL» № ФСР 2010/07826
  • «АмплиСенс® Vibrio cholerae-FL» № ФСР 2011/11139)
  • Rotavirus grA
  • Norovirus GII
  • Adenovirus grF (40, 41 type)
  • Astrovirus (Астровирусы человека - HastV)
  • Salmonella spp
  • комплекс Shigella spp + Энтероинвазивные E. coli (EIEC)
  • термофильные кампилобактерии (С. Jejuni, C. coli, C. lari)
  • Y. enterocolitica
  • Y. pseudotuberculosis
  • Salmonella typhi
  • Vibrio cholerae
  • Энтерогеморрагические E. coli (ЕНЕС)
  • Энтеропатогенные Е. coli (EPEC)
  • Энтеротоксигенные Е. coli (EТEC)
  • Энтероаггрегативные Е. coli (EAgEC)

В рамках проведения научно-исследовательских работ используются методики выявления следующих патогенов:

  • Rotavirus grС
  • Norovirus GI
  • Sapovirus
  • Parechovirus
  • атипичные Astrovirus (Астровирусы млекопитающих, не относимые к HAstV - non - HastV (HMO, MLB, VA)
  • Cronobacter sakazakii (Enterobacter sakazakii)
  • Vibrio parahaemolyticus
    (данный спектр постоянно пополняется методами детекции новых групп патогенов)

Методы характеристики возбудителей ОКИ

Методы субвидового типирования вирусных возбудителей ОКИ:
  • прямое секвенирование вариабельных участков генома (Rotavirus, Norovirus, Sapovirus, Astrovirus, Adenovirus и др вирусных агентов) (данные участки являются альтернативными по отношению к участкам детектируемым диагностическими наборами реагентов)
  • антигенное типирование ротавирусов гр А ([P]G генотипирование) с применением Real-Time PCR (G 1,2,3,4,9,12 типы, Р [4],[6],[8] типы). Методы характеристики бактериальных возбудителей ОКИ:
  • методы рутинной идентификации и субвидового типирования (биохимическое типирование, антибиотикорезистентность, фаготипирование, серотипирование, прямое секвенирование рибосомальных генов)
  • генетическое "серотипирование" энтерогеморрагических E. coli (ЕНЕС) Установление принадлежности к серогруппам: О157, О111, О26, О145, О55, О113, О103, О91, О104, О121 с применением группоспецифичной Real-Time PCR. Установление серотиповой принадлежности методом прямого секвенирования генов жгутикового антигена.
  • Субвидовое типирование бактериальных патогенов (Enterobacteriaceae, Vibrio spp) с применением метода анализа набора продуктов рестрикции >- тотальной ДНК в пульсирующем электрическом поле - пульс-электрофорез (PFGE - Pulsed Field Gel Electrophoresis) с использованием стандартизованных протоколов PulseNet International Network
  • Субвидовое типирование бактериальных патогенов (Salmonella spp., Shigella spp.) с применением метода анализа амплификации и анализа участков ДНК содержащих минисаттелитные повторы (VNTR-повторы) - (MLVA).